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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

244

NOMBRE DE NOTICES

86

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

88 %

MOTS CLES

Antibiotic resistance Microbiology Genome evolution Escherichia coli Metagenomics Bacteroidetes Rhizobia Horizontal gene transfer Symbiosis Metabolomics Rhizobium Continuous culture ACL Genomics Heavy metal resistance Pathogenicity Genome-scale metabolic networks Mobile genetic elements DNA Clostridioides difficile Cyanobacteria Acyl homoserine lactone Average nucleotide identity Genome Agrobacterium tumefaciens Comparative genomics Transcriptome Bacterial DDDH Phylogeny Virulence factors Evolution Biofilm Bactérie Anaerobic Gut microbiota Fish pathogen Nitrogen fixation Bactérie entomopathogène Bioremediation Bacterium Thermococcus Digital DNA-DNA hybridization FAMILY Acidithiobacillus ferrooxidans Complete genome Polyphasic taxonomy Archaea Fish-pathogenic bacteria Oxidative stress CTX-M-15 Bacteriophage Transcriptomics Bacteria Plasmid Coevolution Directed evolution Functional genomics Genomes Activated sludge Flavobacterium psychrophilum Mineral weathering Functional annotation Brochothrix thermosphacta Fitness cost Proteomics Flavobacteriaceae Actinorhizal symbiosis ESBL Pangenome Bacteriocin Lactic acid bacteria Fish pathogens Alkaline thermal spring Secondary metabolites Genome sequence Dehalogenation Adaptation Arsenic Acinetobacter baumannii Acid mine drainage AMD Gene regulation HGT Aquaculture Magnetotactic bacteria Dichloromethane Genome mining Food Biodiversity Galactose Bioassays Bacterial genetics Comparative genomic analysis Experimental evolution Virulence Metabolism Thermophile Betaproteobacteria Formate assimilation Entomopathogenic bacteria